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The Art of Molecular Dynamics Simulation
 
 
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The Art of Molecular Dynamics Simulation [Englisch] [Gebundene Ausgabe]

D. C. Rapaport (Autor)
3.8 von 5 Sternen  Alle Rezensionen anzeigen (5 Kundenrezensionen)
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Produktinformation

  • Gebundene Ausgabe: 564 Seiten
  • Verlag: Cambridge University Press; Auflage: 2 (1. April 2004)
  • Sprache: Englisch
  • ISBN-10: 0521825687
  • ISBN-13: 978-0521825689
  • Größe und/oder Gewicht: 25,4 x 17,1 x 2,9 cm
  • Durchschnittliche Kundenbewertung: 3.8 von 5 Sternen  Alle Rezensionen anzeigen (5 Kundenrezensionen)
  • Amazon Bestseller-Rang: Nr. 113.417 in Englische Bücher (Siehe Top 100 in Englische Bücher)

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D. C. Rapaport
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Produktbeschreibungen

Pressestimmen

From reviews of the first edition: 'The book is very thorough … wide-ranging, clearly written and easy to follow … All in all a most useful book. I recommend it strongly to all researchers involved with molecular dynamics.' M. G. B. Drew, Computers and Chemistry

'What Press et al.'s Numerical Recipes … did for scientific computing in general, Dennis Rapaport's new book will do for the field of molecular-dynamics … simulation … Rapaport's book is useful … and it deserves wide readership.' R. L. Blumberg Selinger, Computers in Physics

'The book takes the reader from the beginnings of MD through to a fully featured MD simulation program with each step along the way being explained clearly … The book … is well written and deals easily with the complexities of the subject. I would gladly recommend it to any researcher in the field.' Chemistry & Industry

Über das Produkt

The extremely powerful technique of molecular dynamics simulation involves solving the classical many-body problem in contexts relevant to the study of matter at the atomistic level. The second edition of the book includes a substantial amount of new material as well as completely rewritten software.
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Einleitungssatz
The origins of molecular dynamics-MD-are rooted in the atomism of antiquity. Lesen Sie die erste Seite
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Format:Gebundene Ausgabe
Strengths: Excellent selection of topics, with good references and enough discussion of the underlying scientific theory. Thoughtful and well-written. DO NOT USE MERELY AS A COOKBOOK!

Weaknesses: Antiquated code, basically FORTRAN with a C veneer. Although the code works as is and is blazingly fast, it's not usable as a basis for further code development -- readers will want to recast the ideas and algorithms in their own up-to-date C code. For example, his arrays start at 1; the only data structure is the array (ugh!), there are no structures. Things get hard to understand when he starts packing multiple array indices into a single composite index, then unpacks it (see, e.g., the code on autocorrelation functions, Chap. 5).

However, the awkward code is a blessing in disguise -- write your own and you'll learn an incredible amount! This book gives you all the conceptual tools to do this, and you can use the code supplied (available from the publisher) as a benchmark and check. Actually, there are a few bugs in the code, but considering its complexity (much of which is unavoidable), it is remarkably reliable. In general, the code is optimized for efficiency, not for ease of maintenance or generalization.

The author deserves any amount of thanks for writing this unique and indispensable book, which is clearly the fruit of many years of practical computing experience in a 70's, early 80's UNIX environment. The code has not aged well, but the ideas it embodies are timeless.

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Not very usuable 4. Januar 2000
Format:Gebundene Ausgabe
The code seems to me unclear ,unelegant and slow. Code of the book on the web is unnecessarily complex and hard to understand.

This is a book of simplistic recipes without formal explanation. So is not usable to learn or understand.

If you are learning buy Statistical Mechanics by Rowley , Understanding Molecular Simulation by Frenkel or Computer Simulation of liquids by Allen.

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Not really C 16. August 1999
Format:Taschenbuch
The code examples are in C, but the author tries to write it "Fortran style". Basically it seems almost as if the code was converted from Fortran code to C by f2c (a GNU translation program). It really seems as if the author's background is in Fortran and hasn't really grasped the fundamental C approach to writing code. However, if you can manage to decipher the code, the technical information is very useful. Most molecular dynamics books still seem to be directed at the Fortran audience, so this is probably as close as you will come to a book for the C audience.
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